54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0464 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0464  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11791  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.469395  normal  0.0438894 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11071  hypothetical protein  75.37 
 
 
134 aa  211  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11061  hypothetical protein  74.63 
 
 
134 aa  209  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1027  hypothetical protein  73.88 
 
 
134 aa  204  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00407266  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11021  hypothetical protein  70.9 
 
 
137 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0651  hypothetical protein  55.38 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1709  hypothetical protein  55.8 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  39.34 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  37.96 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1852  hypothetical protein  36.67 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1826  hypothetical protein  36.67 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  37.25 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  31.09 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  33.94 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  33.94 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  33.96 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  33.94 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  33.02 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  33.03 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  33.03 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  34.74 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  32.5 
 
 
127 aa  55.1  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  30.63 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  32.35 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  32.77 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  32 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  30.28 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  31 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  34.21 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  25.98 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  30.61 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  29.59 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  26.32 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  28.93 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  25.83 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  28.07 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  26.23 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  28.75 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  28.75 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  27.5 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  28.75 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  30.11 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  29.46 
 
 
130 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  27.5 
 
 
123 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  30.69 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  27.5 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  27.5 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  31.46 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  29.03 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  26.6 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0756  hypothetical protein  30.28 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  27.5 
 
 
123 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  27.5 
 
 
123 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>