42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1027 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1027  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  273  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00407266  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11071  hypothetical protein  94.03 
 
 
134 aa  260  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11061  hypothetical protein  91.79 
 
 
134 aa  254  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11021  hypothetical protein  79.1 
 
 
137 aa  206  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11791  hypothetical protein  73.88 
 
 
139 aa  204  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.469395  normal  0.0438894 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0464  hypothetical protein  73.88 
 
 
139 aa  204  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0651  hypothetical protein  49.23 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1709  hypothetical protein  49.25 
 
 
150 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  37.07 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  38.53 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1852  hypothetical protein  32.28 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1826  hypothetical protein  32.28 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  38.75 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  32.76 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  32.73 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  30 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  30 
 
 
127 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0756  hypothetical protein  31.19 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  32.18 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  31.45 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  31.45 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  27.2 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  30.08 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  30.65 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  29.84 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  30.61 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  28.07 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  29.84 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  30.09 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  29.91 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  30.17 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  30.97 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  30.17 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  25.41 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  25.83 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  26.55 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  28.1 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  25.83 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  26.55 
 
 
123 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  26.8 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  26.55 
 
 
123 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>