51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0651 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0651  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  262  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1709  hypothetical protein  84.62 
 
 
150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11791  hypothetical protein  56.15 
 
 
139 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.469395  normal  0.0438894 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0464  hypothetical protein  56.15 
 
 
139 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11061  hypothetical protein  50.77 
 
 
134 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11071  hypothetical protein  48.46 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1027  hypothetical protein  49.23 
 
 
134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00407266  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11021  hypothetical protein  49.59 
 
 
137 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  50 
 
 
131 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  42.11 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1852  hypothetical protein  44.12 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1826  hypothetical protein  44.12 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  37.5 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  38.46 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  35.56 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  32.77 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2347  membrane protein-like protein  37.17 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1510  membrane protein-like protein  37.17 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  32.99 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  28.87 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  32.8 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  30.53 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0661  hypothetical protein  31.43 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  33.66 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  29.9 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  32.41 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  33.66 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  33.66 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  29.06 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  37.33 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  32.14 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0752  hypothetical protein  31.43 
 
 
243 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2042  hypothetical protein  31.43 
 
 
243 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  32.67 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  33.72 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  34.52 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  28.95 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  30.39 
 
 
127 aa  42  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  28.95 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  34.52 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  28.95 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  28.95 
 
 
123 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  27.19 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  28.46 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  30.93 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2325  membrane protein-like protein  29.27 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.540964 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2308  hypothetical protein  27.42 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.868044 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1928  transmembrane protein  26.09 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>