100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1222 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  256  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  58.4 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  56 
 
 		 127 aa  157  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  55.12 
 
 		 127 aa  156  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  57.94 
 
 		 127 aa  156  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  56.69 
 
 		 127 aa  154  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  57.48 
 
 		 127 aa  153  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  55.91 
 
 		 127 aa  153  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  55.91 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  55.12 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  55.12 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  55.12 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  55.12 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  57.03 
 
 		 128 aa  150  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  55.47 
 
 		 128 aa  147  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  56 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  51.2 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  56.25 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  57.27 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  47.9 
 
 		 133 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  50.88 
 
 		 130 aa  110  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  47.17 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  42.37 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  39.52 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  38.71 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2042  hypothetical protein  40.83 
 
 		 243 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0752  hypothetical protein  40.83 
 
 		 243 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0661  hypothetical protein  41.18 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850631  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  38.71 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1928  transmembrane protein  40.34 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  38.71 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  38.71 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  38.71 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0756  hypothetical protein  43.41 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  38.89 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  38.98 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  38.89 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0380  hypothetical protein  43.36 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  40.68 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  38.89 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4798  hypothetical protein  43.36 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  35.2 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  38.1 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  40.71 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  33.07 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11791  hypothetical protein  35.96 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.469395  normal  0.0438894 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0464  hypothetical protein  35.96 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0734  putative transmembrane protein  41.96 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106149  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  40.71 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  34.75 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  39.68 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0321  membrane protein-like protein  40.16 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0441228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1852  hypothetical protein  36.07 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  34.65 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  41.07 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1826  hypothetical protein  36.07 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0294  membrane protein-like protein  37.01 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  32.28 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  35.64 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0927  hypothetical protein  33.91 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  34.75 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2325  membrane protein-like protein  42.42 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540964 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1027  hypothetical protein  38.75 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00407266  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11061  hypothetical protein  38.27 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11071  hypothetical protein  37.04 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  31.58 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11021  hypothetical protein  37.04 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0816  hypothetical protein  36.89 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02203  hypothetical protein  30.3 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  32.69 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2308  hypothetical protein  32.54 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0831  transmembrane protein  36.29 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2005  hypothetical protein  34.13 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  32 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1510  membrane protein-like protein  33.6 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2347  membrane protein-like protein  33.6 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2531  hypothetical protein  34.74 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247104  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  28.81 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  31.37 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  25.78 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  23.96 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  34.78 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  25.4 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4900  membrane protein-like protein  34.38 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0651  hypothetical protein  35.63 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  32.99 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  27.78 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  25.88 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  28.57 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  34.44 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3991  hypothetical protein  35.06 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  28.57 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  28.21 
 
 		 133 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01340  expressed protein  23.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0155606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  35.56 
 
 		 137 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  28.72 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  28.57 
 
 		 130 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  28.21 
 
 		 135 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  28.21 
 
 		 135 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>