28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0935 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  264  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  89.78 
 
 
137 aa  221  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  65.44 
 
 
139 aa  190  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  48.78 
 
 
133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  48.78 
 
 
133 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  47.2 
 
 
133 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0187  hypothetical protein  50.48 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  46.83 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  40 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  38.33 
 
 
130 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  36.44 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  36 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  35.92 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  35.92 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  34.04 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  28.83 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  32.73 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  30.53 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  28.83 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3507  inner membrane protein  28 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.540639  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  31.09 
 
 
133 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  35.05 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  34.29 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2313  hypothetical protein  25.81 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0716954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  34.44 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  36.36 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  36.36 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  29.41 
 
 
136 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>