19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3507 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3507  inner membrane protein  100 
 
 		 130 aa  259  8.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.540639  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  44.12 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  47.62 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  38.81 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  40 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  40 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  43.75 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  36.51 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  30.4 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  30.95 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  25.78 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  26.98 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  31.62 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  29.37 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  29.59 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4095  hypothetical protein  36.96 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  29.59 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  33.33 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>