32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1921 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  265  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  89.78 
 
 		 137 aa  210  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  67.15 
 
 		 139 aa  193  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  49.59 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  50.41 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  48.8 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0187  hypothetical protein  53.33 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  44 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  46.83 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  40 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  35.48 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  35.71 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  35.14 
 
 		 128 aa  67  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  34.91 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  34.91 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  30.63 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  32.73 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  30.63 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  32.63 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  31.4 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  37.11 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3507  inner membrane protein  27.2 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.540639  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  36.63 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  36.36 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  36.36 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  36.36 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  36.96 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  35.56 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  35.05 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  36.96 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  33.64 
 
 		 128 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>