59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0501 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  100 
 
 		 130 aa  256  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  44.19 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  44.19 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  46.15 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  46.83 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  39.45 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  34.88 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  35.51 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  36.43 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  36.72 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  39.06 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  34.65 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0187  hypothetical protein  38.39 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  32.82 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  32.82 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  35.38 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  32.82 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2313  hypothetical protein  32.79 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0716954  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  35.4 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2820  hypothetical protein  34.82 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  33.6 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  37.35 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2626  hypothetical protein  34.48 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139688 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  29.06 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3991  hypothetical protein  33.04 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  43.06 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  34.67 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  37.36 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  34.13 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  34.13 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  35.44 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  40.91 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  34.13 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  36.25 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  35.53 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  37.62 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  39.47 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  35.53 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1510  membrane protein-like protein  40 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  32.5 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  39.74 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  41.89 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2347  membrane protein-like protein  40 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  39.47 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3507  inner membrane protein  33.33 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.540639  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  30.69 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  35.05 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0321  membrane protein-like protein  34.78 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0441228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11061  hypothetical protein  25.83 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0294  membrane protein-like protein  36.23 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11071  hypothetical protein  25 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11791  hypothetical protein  29.46 
 
 		 139 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.469395  normal  0.0438894 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0464  hypothetical protein  29.46 
 
 		 139 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0588  membrane protein-like protein  45.1 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.349139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  29 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>