16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01340 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB01340  expressed protein  100 
 
 		 147 aa  309  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0155606  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00032  conserved hypothetical protein  29.36 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02556  conserved hypothetical protein  35.9 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383553  normal  0.76386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  35.37 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  25.69 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  27.5 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  24.35 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  30.43 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  29 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  27.1 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  26.26 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  27.78 
 
 		 126 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  23.53 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  27.87 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  29.17 
 
 		 159 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  28.43 
 
 		 128 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>