41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1024 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  100 
 
 		 92 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  66.3 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  67.02 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  65.96 
 
 		 94 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  67.39 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  61.96 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  61.96 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  58.7 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  63.04 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  61.29 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  54.26 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  54.26 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  54.84 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  46.74 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  48.89 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  64.71 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  64.71 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  62.32 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  62.37 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  63.24 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  64.18 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  56.52 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  59.14 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  56.99 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  50 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  49.47 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  47.83 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  56.72 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  39.78 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  44.12 
 
 		 335 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  44.12 
 
 		 338 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  44.12 
 
 		 338 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  42.03 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  44.68 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  43.48 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  32.1 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  40 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  34.62 
 
 		 184 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  36.21 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  40.82 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>