34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1303 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  46.15 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  44.44 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  41.76 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  43.96 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  42.86 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  41.76 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  39.78 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  40.66 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  38.71 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  40.66 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  41.57 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  41.3 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  41.79 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  35.87 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  40.58 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  35.79 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  41.18 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  41.18 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  41.18 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  41.18 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  41.43 
 
 		 91 aa  48.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  34.38 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  34.38 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  36.67 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  37.31 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  41.27 
 
 		 335 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  35.29 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  36.11 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  38.1 
 
 		 338 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  38.1 
 
 		 338 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>