38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0612 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  100 
 
 
91 aa  177  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  82.42 
 
 
90 aa  150  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  72.53 
 
 
90 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  68.13 
 
 
90 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  67.03 
 
 
90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  64.84 
 
 
90 aa  117  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  75.82 
 
 
91 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  58.89 
 
 
95 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  64.84 
 
 
90 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  61.29 
 
 
92 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  59.09 
 
 
92 aa  96.7  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  54.76 
 
 
95 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  61.54 
 
 
98 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  58.24 
 
 
91 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  50.56 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  46.15 
 
 
90 aa  89.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  60 
 
 
94 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  56.84 
 
 
94 aa  85.5  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  55.43 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  55.43 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  59.34 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  48.42 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  48.42 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  51.61 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  55.71 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  50 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  59.42 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  59.42 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  52.94 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  38.64 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  41.05 
 
 
93 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  41.3 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  34.45 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  43.33 
 
 
335 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  38.98 
 
 
338 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  38.98 
 
 
338 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  35.64 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  35.21 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>