33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2073 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  663    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  97.63 
 
 
338 aa  624  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  85.37 
 
 
335 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  44.12 
 
 
92 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  39.13 
 
 
91 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  44.83 
 
 
89 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  40 
 
 
92 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  42.37 
 
 
92 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  39.66 
 
 
90 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  40.85 
 
 
95 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  44.07 
 
 
92 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  35.56 
 
 
90 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  39.66 
 
 
93 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  44.07 
 
 
92 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  38.33 
 
 
94 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  38.33 
 
 
94 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  38.1 
 
 
91 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  39.66 
 
 
90 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  42.37 
 
 
92 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  39.24 
 
 
95 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  39.24 
 
 
95 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  34.44 
 
 
90 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  39.66 
 
 
90 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  44.07 
 
 
89 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  36.84 
 
 
101 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  44.07 
 
 
89 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  31.25 
 
 
90 aa  46.6  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  36.21 
 
 
90 aa  46.2  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  38.98 
 
 
91 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  32.39 
 
 
98 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  36.21 
 
 
90 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  30.1 
 
 
234 aa  43.9  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  40.68 
 
 
89 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>