38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3509 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  66.67 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  61.54 
 
 		 98 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  59.78 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  55.43 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  54.35 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  52.75 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  54.84 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  51.69 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  58.24 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  52.22 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  47.25 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  54.02 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  45.16 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  53.09 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  46.32 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  47.73 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  47.73 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  47.83 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  49.46 
 
 		 89 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  50.72 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  46.74 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  42.05 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  42.05 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  43.48 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  40.91 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  44.09 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  50.82 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  50.82 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  39.13 
 
 		 335 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  39.13 
 
 		 338 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  39.13 
 
 		 338 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  35.71 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  35.87 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  46.67 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0847  hypothetical protein  31.43 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00928688  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  43.18 
 
 		 225 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>