35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0335 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  100 
 
 		 92 aa  186  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  74.19 
 
 		 98 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  66.67 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  65.12 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  60.87 
 
 		 90 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  63.95 
 
 		 90 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  59.78 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  57.61 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  59.09 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  51.11 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  58.14 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  47.83 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  53.25 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  47.73 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  48.94 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  57.14 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  52.13 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  59.7 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  50 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  43.82 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  43.82 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  47.87 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  47.83 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  49.28 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  41.67 
 
 		 335 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  43.82 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  40 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  40 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  46.97 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  39.78 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  42.7 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  38.37 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  45.45 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  38.46 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>