30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3165 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  100 
 
 		 95 aa  189  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  74.71 
 
 		 95 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  54.76 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  58.33 
 
 		 90 aa  95.9  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  54.76 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  55.81 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  54.65 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  56.1 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  58.33 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  54.02 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  47.73 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  48.24 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  55.88 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  47.19 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  40.7 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  42.39 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  42.22 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  42.22 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  40.22 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  39.78 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  40.48 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  40.48 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  45.59 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  39.08 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  40.28 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  37.36 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  36.26 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  36.26 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  37.88 
 
 		 92 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>