39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4121 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  83.33 
 
 		 90 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  80 
 
 		 90 aa  154  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  82.22 
 
 		 90 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  78.89 
 
 		 90 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  70 
 
 		 90 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  72.53 
 
 		 91 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  55.56 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  74.73 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  56.82 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  63.95 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  60 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  61.96 
 
 		 92 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  61.11 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  55.56 
 
 		 91 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  60.64 
 
 		 94 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  58.33 
 
 		 95 aa  95.9  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  60.87 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  58.51 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  60.87 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  63.74 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  51.06 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  51.06 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  59.42 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  53.85 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  53.85 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  52.75 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  58.21 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  43.68 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  45.05 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  37.21 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  40.66 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  44.07 
 
 		 335 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  39.66 
 
 		 338 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  39.66 
 
 		 338 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  30.25 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  30 
 
 		 101 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  45.45 
 
 		 126 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  40.58 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>