38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4139 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  95.56 
 
 		 90 aa  174  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  80 
 
 		 90 aa  154  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  74.44 
 
 		 90 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  71.11 
 
 		 90 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  64.44 
 
 		 90 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  64.84 
 
 		 91 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  57.95 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  54.44 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  58.7 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  59.78 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  60 
 
 		 98 aa  103  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  67.03 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  54.44 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  57.45 
 
 		 94 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  54.35 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  55.32 
 
 		 94 aa  94  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  55.81 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  58.7 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  61.54 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  56.52 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  46.81 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  46.81 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  55.07 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  48.86 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  47.73 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  46.59 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  52.24 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  45.33 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  40.7 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  39.13 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  34.44 
 
 		 335 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  34.44 
 
 		 338 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  34.44 
 
 		 338 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  36.05 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  38.6 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  44.44 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  25.89 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>