42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4043 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  100 
 
 		 94 aa  189  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  96.81 
 
 		 94 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  65.96 
 
 		 92 aa  120  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  63.83 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  61.7 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  58.51 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  59.57 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  60 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  60.64 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  59.57 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  50.56 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  45.74 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  54.26 
 
 		 98 aa  87  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  53.68 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  53.68 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  53.68 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  50 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  52.69 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  57.89 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  52.69 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  57.89 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  51.61 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  54.74 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  58.82 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  55.32 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  56.84 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  43.62 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  42.39 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  54.41 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  38.96 
 
 		 89 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  38.33 
 
 		 338 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  38.33 
 
 		 338 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  38.33 
 
 		 335 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  38.95 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  38.61 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3170  cytochrome c, class III  27.03 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000276293  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  38.55 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  43.48 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  32.35 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  40.43 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  38.98 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  38.57 
 
 		 254 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>