39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4124 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  174  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  67.03 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  63.74 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  64.84 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  62.64 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  63.74 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  61.54 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  57.14 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  62.64 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  59.34 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  56.52 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  46.15 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  50.56 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  61.96 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  53.19 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  52.13 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  47.87 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  49.46 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  47.87 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  47.19 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  44.09 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  47.5 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  45.35 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  42.22 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  52.17 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  45.56 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  51.52 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  51.52 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  45.35 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  51.52 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  42.86 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  44.83 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  44.83 
 
 		 338 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  44.83 
 
 		 338 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  31.03 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  37.1 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  33.33 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  43.75 
 
 		 184 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  35.29 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>