28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1628 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  100 
 
 		 101 aa  210  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  35.48 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  35 
 
 		 89 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  36.84 
 
 		 335 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  36.84 
 
 		 338 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  34 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  37.5 
 
 		 338 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  34.92 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  34.92 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  36.84 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  34.92 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  37.31 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  35.21 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  31.58 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  33.33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  30.69 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  33.33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  33.33 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  38.6 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  38.98 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  38.6 
 
 		 90 aa  42.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  38.98 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  36.21 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  30 
 
 		 90 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  28.06 
 
 		 142 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  36.21 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  37.5 
 
 		 90 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>