38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0364 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  100 
 
 		 91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  75.82 
 
 		 91 aa  139  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  74.73 
 
 		 90 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  71.43 
 
 		 90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  67.03 
 
 		 90 aa  124  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  70.33 
 
 		 90 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  65.93 
 
 		 90 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  72.53 
 
 		 90 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  62.37 
 
 		 92 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  54.44 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  51.65 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  52.81 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  53.57 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  57.61 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  57.61 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  53.85 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  52.69 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  61.96 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  51.65 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  54.74 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  52.63 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  50.53 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  50.53 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  50.54 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  57.14 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  57.35 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  49.46 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  49.46 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  43.96 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  46.32 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  37.21 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  40.79 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  42.19 
 
 		 335 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  38.1 
 
 		 338 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  38.1 
 
 		 338 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  37.04 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  36.21 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  43.48 
 
 		 337 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>