38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3166 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  100 
 
 		 90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  78.89 
 
 		 90 aa  148  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  75.56 
 
 		 90 aa  144  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  78.89 
 
 		 90 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  74.44 
 
 		 90 aa  141  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  71.11 
 
 		 90 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  64.84 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  67.39 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  55.68 
 
 		 90 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  52.22 
 
 		 90 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  72.53 
 
 		 91 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  54.44 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  59.3 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  53.76 
 
 		 98 aa  100  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  53.33 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  58.33 
 
 		 95 aa  97.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  57.45 
 
 		 94 aa  95.9  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  56.38 
 
 		 94 aa  94.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  62.64 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  58.7 
 
 		 89 aa  91.3  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  56.52 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  51.65 
 
 		 95 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  51.65 
 
 		 95 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  59.42 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  58.21 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  51.65 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  51.65 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  50.55 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  42.22 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  43.48 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  42.67 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  38.37 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  45.76 
 
 		 335 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  39.66 
 
 		 338 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  39.66 
 
 		 338 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  40 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  42.59 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  29 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>