38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3521 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  175  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  95.51 
 
 		 89 aa  168  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  64.13 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  58.89 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  60.87 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  56.52 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  55.43 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  55.43 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  56.52 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  47.83 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  56.99 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  57.61 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  52.17 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  47.25 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  54.74 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  53.68 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  46.67 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  48.35 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  43.48 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  47.87 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  45.26 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  45.26 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  44.83 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  44.57 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  48.35 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  48.35 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  48.35 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  40.48 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  48.57 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  44.07 
 
 		 335 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  49.25 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  35 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  44.07 
 
 		 338 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  44.07 
 
 		 338 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  35.29 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  36.99 
 
 		 711 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>