36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1846 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  100 
 
 		 90 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  62.5 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  54.44 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  54.44 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  52.22 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  51.11 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  47.83 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  51.65 
 
 		 91 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  46.74 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  46.15 
 
 		 91 aa  89.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  47.25 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  49.43 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  46.15 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  43.62 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  55.07 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  48.28 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  48.91 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  47.83 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  40.7 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  42.39 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  42.39 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  47.83 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  37.5 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  44.78 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  36.36 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  43.28 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  41.54 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  41.76 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  36.96 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  36.21 
 
 		 335 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  36.21 
 
 		 338 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  36.21 
 
 		 338 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  31.76 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  43.4 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>