33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0365 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  100 
 
 		 95 aa  192  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  74.71 
 
 		 95 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  58.89 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  58.89 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  60 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  54.44 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  53.33 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  54.44 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  54.44 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  54.44 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  52.17 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  53.25 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  49.4 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  53.09 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  48.28 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  47.83 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  47.25 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  47.25 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  43.53 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  43.53 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  42.22 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  41.49 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  45.59 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  40.43 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  45.68 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  38.82 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  41.27 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  38.81 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  41.27 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  41.27 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  40.85 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  35.44 
 
 		 335 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  31 
 
 		 479 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>