34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2758 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  52.13 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  53.85 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  51.09 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  49.46 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  50.55 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  50 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  48.35 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  43.48 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  47.37 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  47.37 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  45.68 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  45.05 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  39.08 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  40 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  45.83 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  42.22 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  41.76 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  40.22 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  58.06 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  36.96 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  49.18 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  44.68 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  39.13 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  42.37 
 
 		 335 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  48.33 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  48.33 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  48.33 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  46.67 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  40.68 
 
 		 338 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  40.68 
 
 		 338 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  41.05 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  44.44 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>