38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1696 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  100 
 
 		 95 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  97.89 
 
 		 95 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  97.89 
 
 		 95 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  68.82 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  68.82 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  68.82 
 
 		 92 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  77.94 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  61.46 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  54.26 
 
 		 92 aa  93.6  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  55.32 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  52.13 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  48.94 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  47.87 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  46.59 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  54.74 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  49.47 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  53.68 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  51.65 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  43.48 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  57.14 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  50.57 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  43.82 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  48.42 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  42.86 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  46.32 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  42.35 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  42.7 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  38.14 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  46.32 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  38.55 
 
 		 335 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  39.24 
 
 		 338 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  39.24 
 
 		 338 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  34.92 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  29.17 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  35.71 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  30.43 
 
 		 126 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2715  acidic cytochrome c3  33.7 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>