38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2159 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  100 
 
 
95 aa  187  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  100 
 
 
95 aa  187  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  97.89 
 
 
95 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  68.82 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  68.82 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  68.82 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  77.94 
 
 
92 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  54.26 
 
 
92 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  73.53 
 
 
93 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  54.26 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  51.06 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  47.87 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  47.73 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  51.65 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  48.94 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  46.81 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  53.68 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  52.63 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  48.42 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  42.39 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  57.14 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  47.73 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  43.82 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  41.76 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  47.37 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  45.26 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  40.21 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  43.53 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  42.22 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  47.37 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  40.51 
 
 
335 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  36.14 
 
 
338 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  36.14 
 
 
338 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  34.92 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  29.17 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  36.11 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  30.43 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2715  acidic cytochrome c3  32.98 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>