41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0209 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  100 
 
 		 98 aa  197  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  74.19 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  61.54 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  61.29 
 
 		 90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  62.22 
 
 		 90 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  61.11 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  60 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  61.54 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  56.18 
 
 		 90 aa  95.9  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  52.27 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  51.61 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  52.17 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  49.43 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  54.26 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  52.13 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  53.85 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  47.19 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  49.47 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  54.79 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  46.74 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  40.21 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  40.21 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  51.39 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  44.57 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  45.83 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  36.9 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  33.8 
 
 		 335 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  35.48 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  35.48 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  32.39 
 
 		 338 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  43.48 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  32.39 
 
 		 338 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  34.41 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  39.71 
 
 		 93 aa  43.5  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  37.5 
 
 		 722 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  37.76 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  35.94 
 
 		 731 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  34.38 
 
 		 738 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  34.38 
 
 		 719 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  34.91 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  34.38 
 
 		 735 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>