38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2902 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  100 
 
 		 90 aa  181  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  82.42 
 
 		 91 aa  150  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  70 
 
 		 90 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  75.56 
 
 		 90 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  66.67 
 
 		 90 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  66.67 
 
 		 90 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  64.44 
 
 		 90 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  66.3 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  65.12 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  61.29 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  58.89 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  71.43 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  54.55 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  59.78 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  51.11 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  59.57 
 
 		 94 aa  95.9  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  54.76 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  58.51 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  47.87 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  47.87 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  55.56 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  54.35 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  57.35 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  52.17 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  51.09 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  47.83 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  56.72 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  55.22 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  55.22 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  44.74 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  38.64 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  38.3 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  44.07 
 
 		 335 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  39.66 
 
 		 338 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  39.66 
 
 		 338 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  36.84 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  37.04 
 
 		 184 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  40.91 
 
 		 126 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>