38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4049 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  95.56 
 
 		 90 aa  174  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  83.33 
 
 		 90 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  77.78 
 
 		 90 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  74.44 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  66.67 
 
 		 90 aa  127  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  67.03 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  59.09 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  55.56 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  61.96 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  60.87 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  62.22 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  65.93 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  59.57 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  53.33 
 
 		 95 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  55.43 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  57.45 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  54.65 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  62.64 
 
 		 89 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  57.61 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  55.43 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  48.94 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  48.94 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  57.97 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  50 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  51.14 
 
 		 92 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  50 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  56.72 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  45.33 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  41.86 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  38.46 
 
 		 335 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  40.22 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  35.56 
 
 		 338 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  35.56 
 
 		 338 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2651  cytochrome c class III  36.05 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.843324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  44.44 
 
 		 184 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  38.6 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  43.18 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>