39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2108 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  100 
 
 
93 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  74.47 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  73.4 
 
 
92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  73.4 
 
 
92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  62.5 
 
 
95 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  62.5 
 
 
95 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  77.27 
 
 
92 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  71.23 
 
 
95 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  49.47 
 
 
92 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  47.87 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  42.11 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  50.54 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  48.96 
 
 
94 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  45.74 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  45.74 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  44.68 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  43.82 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  48.94 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  43.62 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  43.62 
 
 
89 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  45.83 
 
 
89 aa  67  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  46.32 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  36.17 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  41.11 
 
 
90 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  35.87 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  39.13 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  38.71 
 
 
98 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  40.66 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  34.78 
 
 
335 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  41.43 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  27.96 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  33.7 
 
 
338 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  33.7 
 
 
338 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  32.98 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  27.07 
 
 
134 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3182  cytochrome c3  31.73 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.943841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  36.17 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  36.56 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  40.82 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>