39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2248 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  100 
 
 		 92 aa  177  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  98.91 
 
 		 92 aa  176  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  96.74 
 
 		 92 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  68.82 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  68.82 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  84.85 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  70.21 
 
 		 93 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  68.82 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  54.35 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  52.75 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  53.85 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  51.61 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  50.54 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  48.39 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  47.31 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  46.74 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  51.61 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  50.55 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  55.88 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  40.91 
 
 		 91 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  36.36 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  41.76 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  45.35 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  48.35 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  46.15 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  45.56 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  40 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  38.46 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  40.91 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  35.53 
 
 		 338 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  34.41 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  35.53 
 
 		 338 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  32.26 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  36.26 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  31.51 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  40.43 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  28 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  36.69 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  42 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>