246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_pXO1_0206 on replicon NC_007322
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007322  GBAA_pXO1_0206  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0203369  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0146  hfq protein  93.44 
 
 		 61 aa  117  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0267  RNA chaperone Hfq  93.44 
 
 		 61 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1591  host factor-I protein  77.05 
 
 		 61 aa  104  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254839  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5537  RNA chaperone Hfq  58.06 
 
 		 62 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112137 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1723  host factor-I protein  55.17 
 
 		 62 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1801  host factor-I protein  55.17 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1511  host factor protein  55.17 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1744  host factor-I protein  53.45 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1537  host factor-I protein  55.17 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1502  host factor protein  53.45 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1656  host factor-I protein  55.17 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.406982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3655  host factor-I protein  55.17 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1691  host factor-I protein  55.17 
 
 		 62 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1542  RNA chaperone Hfq  53.45 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5625  RNA chaperone Hfq  55.36 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1361  RNA chaperone Hfq  52.54 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000362594  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1174  RNA chaperone Hfq  52.54 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2390  RNA-binding protein Hfq  48.28 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000174663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3740  RNA-binding protein Hfq  48.28 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000182671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3559  RNA-binding protein Hfq  48.28 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3458  RNA-binding protein Hfq  48.28 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000205772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3472  RNA-binding protein Hfq  48.28 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3722  RNA-binding protein Hfq  48.28 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.2599e-36 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3763  RNA-binding protein Hfq  48.28 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3842  RNA-binding protein Hfq  48.28 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000757377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3478  RNA-binding protein Hfq  48.28 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000029119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1490  RNA-binding protein Hfq  48.28 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000177401  normal  0.0133073 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3812  RNA-binding protein Hfq  48.28 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000446161  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1308  RNA chaperone Hfq  49.15 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0115  host factor-I protein  51.79 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569997  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0125  RNA chaperone Hfq  52.63 
 
 		 62 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000196673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0557  RNA chaperone Hfq  50.88 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1881  RNA chaperone Hfq  46.67 
 
 		 80 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.318606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1223  RNA-binding protein Hfq  46.67 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2103  RNA-binding protein Hfq  48.33 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1921  RNA chaperone Hfq  46.67 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2729  RNA chaperone Hfq  44.07 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.943710000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1694  RNA chaperone Hfq  43.33 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0182098  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1116  RNA-binding protein Hfq  46.43 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000543156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1490  RNA chaperone Hfq  43.1 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0924374  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0482  RNA chaperone Hfq  50 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  hitchhiker  0.000910775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2244  RNA-binding protein Hfq  50 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0488883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0774  RNA chaperone Hfq  43.33 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000911615  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1451  RNA-binding protein Hfq  48.21 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1493  RNA-binding protein Hfq  48.21 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.964703  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2843  RNA-binding protein Hfq  48.21 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.736896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1567  RNA-binding protein Hfq  48.21 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104021  normal  0.0520931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1356  RNA-binding protein Hfq  48.21 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.950341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1762  RNA chaperone Hfq  48.21 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.683558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2131  RNA chaperone Hfq  43.33 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.187321  normal  0.0262415 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1272  RNA-binding protein Hfq  48.21 
 
 		 196 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1111  RNA-binding protein Hfq  46.43 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1070  RNA-binding protein Hfq  46.43 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2610  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2208  RNA-binding protein Hfq  46.43 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1613  RNA-binding protein Hfq  44.64 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0980  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714494  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4124  RNA-binding protein Hfq  48.21 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304133  normal  0.524604 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1499  RNA-binding protein Hfq  40.68 
 
 		 84 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000130103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0251  RNA-binding protein Hfq  50 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222579  normal  0.069598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1819  RNA-binding protein Hfq  44.64 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798062  normal  0.0504163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1632  RNA-binding protein Hfq  44.64 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614603  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4393  RNA chaperone Hfq  42.86 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1684  RNA-binding protein Hfq  44.83 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1931  RNA-binding protein Hfq  44.64 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1095  RNA-binding protein Hfq  44.64 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4341  host factor Hfq  43.1 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3124  RNA chaperone Hfq  42.86 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2139  RNA chaperone Hfq  44.64 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2867  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.648341  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1449  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.083877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2878  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2582  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233324  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2594  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1841  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4073  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613894 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0624  RNA-binding protein Hfq  41.38 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00135703  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2942  RNA chaperone Hfq  42.86 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3051  RNA chaperone Hfq  42.86 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1448  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.581854  hitchhiker  0.000378907 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11580  RNA chaperone Hfq  37.93 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2824  RNA chaperone Hfq  42.86 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1493  RNA chaperone Hfq  42.86 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579375  normal  0.208589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6544  RNA chaperone Hfq  42.86 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5942  RNA chaperone Hfq  42.86 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0535  RNA chaperone Hfq  42.86 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1778  putative RNA chaperone Hfq  41.67 
 
 		 238 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000070554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1614  RNA chaperone Hfq  42.62 
 
 		 86 aa  52.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000077462  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1525  RNA chaperone Hfq  42.86 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396727  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2532  hfq protein  41.67 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2786  nucleoprotein, Hfg, host factor I like protein  41.67 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600231  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1413  RNA chaperone Hfq  41.67 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725427  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1711  RNA chaperone Hfq  41.67 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1453  RNA chaperone Hfq  41.67 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1531  RNA chaperone Hfq  41.67 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1722  RNA chaperone Hfq  41.67 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.057332  hitchhiker  0.00002496 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1038  hfq protein  41.67 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00601589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1768  hfq protein  41.67 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00010879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1799  putative RNA chaperone Hfq  41.67 
 
 		 216 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00326257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>