201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5537 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5537  RNA chaperone Hfq  100 
 
 		 62 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112137 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5625  RNA chaperone Hfq  88.33 
 
 		 62 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0115  host factor-I protein  90 
 
 		 62 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1723  host factor-I protein  66.67 
 
 		 62 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1511  host factor protein  68.42 
 
 		 64 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1801  host factor-I protein  68.42 
 
 		 64 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1744  host factor-I protein  66.67 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1537  host factor-I protein  68.42 
 
 		 64 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1656  host factor-I protein  68.42 
 
 		 64 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.406982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3655  host factor-I protein  63.33 
 
 		 62 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1691  host factor-I protein  63.33 
 
 		 62 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1502  host factor protein  66.67 
 
 		 64 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1542  RNA chaperone Hfq  61.67 
 
 		 62 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0125  RNA chaperone Hfq  55.74 
 
 		 62 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000196673  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0206  hypothetical protein  58.06 
 
 		 61 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0203369  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0146  hfq protein  58.06 
 
 		 61 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1591  host factor-I protein  62.9 
 
 		 61 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254839  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0267  RNA chaperone Hfq  58.06 
 
 		 61 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2103  RNA-binding protein Hfq  52.54 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1499  RNA-binding protein Hfq  48.28 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000130103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1223  RNA-binding protein Hfq  50.85 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846944  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0980  hypothetical protein  49.15 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714494  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1308  RNA chaperone Hfq  40 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11580  RNA chaperone Hfq  41.38 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3740  RNA-binding protein Hfq  45.76 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000182671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3763  RNA-binding protein Hfq  45.76 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632531  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3559  RNA-binding protein Hfq  45.76 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3458  RNA-binding protein Hfq  45.76 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000205772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3472  RNA-binding protein Hfq  45.76 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1490  RNA-binding protein Hfq  45.76 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000177401  normal  0.0133073 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3842  RNA-binding protein Hfq  45.76 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000757377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2390  RNA-binding protein Hfq  46.55 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000174663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3812  RNA-binding protein Hfq  45.76 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000446161  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3722  RNA-binding protein Hfq  45.76 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.2599e-36 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1361  RNA chaperone Hfq  42.62 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000362594  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1174  RNA chaperone Hfq  42.62 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3478  RNA-binding protein Hfq  45.76 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000029119  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1490  RNA chaperone Hfq  42.37 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0924374  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3124  RNA chaperone Hfq  44.07 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344226 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1694  RNA chaperone Hfq  44.07 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0182098  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0557  RNA chaperone Hfq  42.37 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0774  RNA chaperone Hfq  42.37 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000911615  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2843  RNA-binding protein Hfq  46.55 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.736896  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1356  RNA-binding protein Hfq  46.55 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.950341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2729  RNA chaperone Hfq  41.38 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.943710000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1451  RNA-binding protein Hfq  46.55 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1881  RNA chaperone Hfq  42.37 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.318606  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1493  RNA-binding protein Hfq  46.55 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.964703  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0251  RNA-binding protein Hfq  45.76 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222579  normal  0.069598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4393  RNA chaperone Hfq  43.86 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2244  RNA-binding protein Hfq  44.83 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0488883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4124  RNA-binding protein Hfq  46.55 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304133  normal  0.524604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1567  RNA-binding protein Hfq  46.55 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104021  normal  0.0520931 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0871  host factor-I protein, putative  40 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.942463  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1921  RNA chaperone Hfq  40.68 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2610  RNA-binding protein Hfq  42.37 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0482  RNA chaperone Hfq  45.61 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  hitchhiker  0.000910775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1613  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1493  RNA chaperone Hfq  43.1 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579375  normal  0.208589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2824  RNA chaperone Hfq  43.1 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2942  RNA chaperone Hfq  43.1 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3051  RNA chaperone Hfq  43.1 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1116  RNA-binding protein Hfq  41.38 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000543156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1762  RNA chaperone Hfq  44.83 
 
 		 175 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.683558  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2867  RNA-binding protein Hfq  41.38 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.648341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1819  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798062  normal  0.0504163 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2208  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1111  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1449  RNA-binding protein Hfq  41.38 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.083877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2878  RNA-binding protein Hfq  41.38 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2582  RNA-binding protein Hfq  41.38 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233324  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2594  RNA-binding protein Hfq  41.38 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1841  RNA-binding protein Hfq  41.38 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5942  RNA chaperone Hfq  43.1 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1448  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.581854  hitchhiker  0.000378907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6544  RNA chaperone Hfq  43.1 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1632  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614603  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2131  RNA chaperone Hfq  40.68 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.187321  normal  0.0262415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4073  RNA-binding protein Hfq  41.38 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613894 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1363  RNA chaperone Hfq  43.86 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000865539  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1070  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1389  RNA chaperone Hfq  43.86 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1095  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2139  RNA chaperone Hfq  42.37 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1684  RNA-binding protein Hfq  41.38 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1525  RNA chaperone Hfq  43.1 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396727  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0535  RNA chaperone Hfq  43.1 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1230  RNA chaperone Hfq  40.98 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2013  RNA chaperone Hfq  43.1 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0666  RNA chaperone Hfq  42.37 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0371951  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2769  RNA chaperone Hfq  38.98 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.731681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0897  RNA chaperone Hfq  42.37 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301883  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0573  RNA chaperone Hfq  39.66 
 
 		 89 aa  48.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174076  hitchhiker  0.000000000517763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1931  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 193 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0121  RNA chaperone Hfq  44.83 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000257179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1272  RNA-binding protein Hfq  42.37 
 
 		 196 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0821  RNA chaperone Hfq  38.98 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0395  RNA chaperone Hfq  43.1 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648221  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0624  RNA-binding protein Hfq  40.35 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00135703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0635  RNA-binding protein Hfq  37.29 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0651031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>