237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_1591 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005957  BT9727_1591  host factor-I protein  100 
 
 		 61 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254839  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0146  hfq protein  83.61 
 
 		 61 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0267  RNA chaperone Hfq  83.61 
 
 		 61 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0206  hypothetical protein  77.05 
 
 		 61 aa  104  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0203369  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5537  RNA chaperone Hfq  62.9 
 
 		 62 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112137 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1723  host factor-I protein  56.9 
 
 		 62 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1801  host factor-I protein  56.9 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1511  host factor protein  56.9 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1537  host factor-I protein  56.9 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1656  host factor-I protein  56.9 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.406982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1744  host factor-I protein  55.17 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1502  host factor protein  55.17 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3655  host factor-I protein  56.9 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1691  host factor-I protein  56.9 
 
 		 62 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1542  RNA chaperone Hfq  55.17 
 
 		 62 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0125  RNA chaperone Hfq  57.89 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000196673  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5625  RNA chaperone Hfq  55.36 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0115  host factor-I protein  55.36 
 
 		 62 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569997  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1308  RNA chaperone Hfq  42.62 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1174  RNA chaperone Hfq  43.86 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1361  RNA chaperone Hfq  43.86 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000362594  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0624  RNA-binding protein Hfq  41.38 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00135703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3812  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000446161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3740  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000182671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3559  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3458  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000205772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3472  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2390  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000174663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3722  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.2599e-36 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3842  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000757377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1490  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000177401  normal  0.0133073 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3763  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3478  RNA-binding protein Hfq  43.1 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000029119  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0482  RNA chaperone Hfq  46.43 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  hitchhiker  0.000910775 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1490  RNA chaperone Hfq  38.33 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0924374  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2843  RNA-binding protein Hfq  44.64 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.736896  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1356  RNA-binding protein Hfq  44.64 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.950341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0980  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714494  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1493  RNA-binding protein Hfq  44.64 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.964703  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1567  RNA-binding protein Hfq  44.64 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104021  normal  0.0520931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1223  RNA-binding protein Hfq  45 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1881  RNA chaperone Hfq  40 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.318606  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1451  RNA-binding protein Hfq  44.64 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2103  RNA-binding protein Hfq  49.12 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1111  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1762  RNA chaperone Hfq  44.64 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.683558  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2244  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0488883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2208  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0557  RNA chaperone Hfq  40.35 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1694  RNA chaperone Hfq  40.35 
 
 		 80 aa  52  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0182098  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1070  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4124  RNA-binding protein Hfq  44.64 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304133  normal  0.524604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4393  RNA chaperone Hfq  39.29 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1613  RNA-binding protein Hfq  41.07 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1819  RNA-binding protein Hfq  41.07 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798062  normal  0.0504163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1116  RNA-binding protein Hfq  41.07 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000543156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1095  RNA-binding protein Hfq  41.07 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1632  RNA-binding protein Hfq  41.07 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614603  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3124  RNA chaperone Hfq  39.29 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344226 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1921  RNA chaperone Hfq  40 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1684  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1272  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 196 aa  50.8  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2729  RNA chaperone Hfq  38.98 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.943710000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2610  RNA-binding protein Hfq  39.29 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1931  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 193 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2139  RNA chaperone Hfq  41.07 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1499  RNA-binding protein Hfq  37.29 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000130103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0251  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222579  normal  0.069598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2878  RNA-binding protein Hfq  39.29 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2867  RNA-binding protein Hfq  39.29 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.648341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4341  host factor Hfq  35.71 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4073  RNA-binding protein Hfq  39.29 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2824  RNA chaperone Hfq  39.29 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1449  RNA-binding protein Hfq  39.29 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.083877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2582  RNA-binding protein Hfq  39.29 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233324  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2942  RNA chaperone Hfq  39.29 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2594  RNA-binding protein Hfq  39.29 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1841  RNA-binding protein Hfq  39.29 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3051  RNA chaperone Hfq  39.29 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1493  RNA chaperone Hfq  39.29 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579375  normal  0.208589 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0774  RNA chaperone Hfq  40.35 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000911615  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0162  RNA chaperone Hfq  38.98 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5942  RNA chaperone Hfq  39.29 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1448  RNA-binding protein Hfq  39.29 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.581854  hitchhiker  0.000378907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6544  RNA chaperone Hfq  39.29 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2131  RNA chaperone Hfq  38.33 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.187321  normal  0.0262415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1525  RNA chaperone Hfq  39.29 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396727  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0535  RNA chaperone Hfq  39.29 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1497  RNA chaperone Hfq  38.33 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00847366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1389  RNA chaperone Hfq  46.81 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1363  RNA chaperone Hfq  46.81 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000865539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1614  RNA chaperone Hfq  41.67 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000077462  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0871  host factor-I protein, putative  41.67 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.942463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0009  hypothetical protein  41.07 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0009  hypothetical protein  41.07 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0666  RNA chaperone Hfq  44.64 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0371951  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0573  RNA chaperone Hfq  41.07 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174076  hitchhiker  0.000000000517763 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1954  Hfq protein  36.21 
 
 		 216 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000604734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1051  host factor Hfq  36.21 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1038  hfq protein  36.21 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00601589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>