More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0001 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 444 aa  900    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000143167  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.61 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000928481  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0001  chromosomal replication initiation protein  44.57 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0001  chromosomal replication initiation protein  46.4 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.71 
 
 		 454 aa  305  8.000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000297027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.45 
 
 		 463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  34.7 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  34.47 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  34.47 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 460 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.82 
 
 		 444 aa  253  7e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  31.99 
 
 		 472 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  32.05 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  32.12 
 
 		 453 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  31.46 
 
 		 450 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.14 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  34.03 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  32.82 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  34.97 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  34.74 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  33.18 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.65 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  32.43 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  32.43 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  32.43 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  32.43 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  33.11 
 
 		 440 aa  245  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  32.43 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  32.42 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.42 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  32.66 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.87 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  32.49 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.18 
 
 		 453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.49 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  31.7 
 
 		 458 aa  243  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.73 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  30.8 
 
 		 481 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.87 
 
 		 503 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  31.84 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.14 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  31.82 
 
 		 460 aa  240  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.79 
 
 		 446 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  31.66 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.86 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.87 
 
 		 439 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  30.98 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.57 
 
 		 458 aa  237  4e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  31.77 
 
 		 456 aa  236  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.18 
 
 		 449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  39.58 
 
 		 500 aa  236  6e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  31.87 
 
 		 492 aa  236  8e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  32.89 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  32.56 
 
 		 445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  33.87 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.65 
 
 		 453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  31.79 
 
 		 470 aa  233  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  30.77 
 
 		 478 aa  233  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  31.91 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  31.91 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  31.75 
 
 		 449 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  30.22 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.55 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  38.53 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  31.75 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.28 
 
 		 441 aa  225  9e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.51 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  30.13 
 
 		 491 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  30.8 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  35.22 
 
 		 462 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0973  chromosomal replication initiation protein  35.22 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0045  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.28 
 
 		 539 aa  224  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.02 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.17 
 
 		 447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  32.87 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  32.06 
 
 		 459 aa  223  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  32.87 
 
 		 440 aa  222  8e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  31.36 
 
 		 450 aa  222  9e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  29.53 
 
 		 464 aa  222  9e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.17 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  32.63 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  31.06 
 
 		 463 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  29.28 
 
 		 454 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  32.71 
 
 		 436 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 		 495 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  32.46 
 
 		 436 aa  219  5e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 		 495 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 		 495 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.82 
 
 		 461 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  29.23 
 
 		 466 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08301  chromosomal replication initiation protein  29.71 
 
 		 463 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.72 
 
 		 498 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0001  chromosomal replication initiation protein  30.37 
 
 		 469 aa  217  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.91 
 
 		 534 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0547  chromosomal replication initiation protein  30.27 
 
 		 455 aa  216  4e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.21 
 
 		 459 aa  216  5e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0001  chromosomal replication initiation protein  34.99 
 
 		 557 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>