More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0547 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0547  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
455 aa  943    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.19 
 
 
454 aa  332  8e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  37.67 
 
 
446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.67 
 
 
446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  37.67 
 
 
446 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  37.67 
 
 
446 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  37.67 
 
 
446 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  37.67 
 
 
446 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  37.67 
 
 
446 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.5 
 
 
453 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  38.62 
 
 
441 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.44 
 
 
446 aa  322  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  37.33 
 
 
446 aa  322  8e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  37.14 
 
 
446 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  37.44 
 
 
446 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  37.18 
 
 
450 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  37.79 
 
 
450 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.39 
 
 
444 aa  317  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  39.23 
 
 
460 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  38.88 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  38.65 
 
 
460 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  38.41 
 
 
461 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  36.9 
 
 
443 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  38.24 
 
 
462 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  38.43 
 
 
460 aa  311  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  38.55 
 
 
462 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  38.55 
 
 
462 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  38.55 
 
 
462 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  38.55 
 
 
462 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  35.67 
 
 
457 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  37.95 
 
 
461 aa  309  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  37.67 
 
 
459 aa  308  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  37.56 
 
 
462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.38 
 
 
462 aa  307  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 
461 aa  306  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  35.67 
 
 
457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  37.56 
 
 
462 aa  306  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.31 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  37.31 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  38.29 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  37.86 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  37.86 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  37.61 
 
 
457 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.24 
 
 
464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 
467 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 
443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  37.09 
 
 
467 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 
478 aa  303  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  35.49 
 
 
495 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.51 
 
 
446 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  37.73 
 
 
445 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  36.32 
 
 
455 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  37.39 
 
 
465 aa  300  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  36.97 
 
 
459 aa  300  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.87 
 
 
443 aa  299  6e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  36.96 
 
 
466 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  36.96 
 
 
466 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  36.96 
 
 
466 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  36.96 
 
 
466 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  37.25 
 
 
465 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  36.07 
 
 
449 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  36.96 
 
 
466 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  35.96 
 
 
451 aa  298  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  38.55 
 
 
450 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.55 
 
 
483 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  39.55 
 
 
453 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  39.55 
 
 
453 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  37.14 
 
 
452 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  36.82 
 
 
482 aa  296  4e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  36.88 
 
 
468 aa  296  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  36.14 
 
 
442 aa  296  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  36.51 
 
 
449 aa  295  9e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  33.47 
 
 
481 aa  295  9e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.03 
 
 
449 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  36.91 
 
 
452 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  36.91 
 
 
452 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  36.09 
 
 
472 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  34.17 
 
 
440 aa  295  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.19 
 
 
469 aa  293  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  36.01 
 
 
445 aa  293  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  36.32 
 
 
454 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  35.62 
 
 
470 aa  293  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  35.82 
 
 
460 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.13 
 
 
442 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  36.44 
 
 
453 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.22 
 
 
455 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  36.44 
 
 
453 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  35.36 
 
 
494 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.52 
 
 
461 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  34.69 
 
 
451 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  34.69 
 
 
451 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  37.28 
 
 
468 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  40.3 
 
 
480 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0001  chromosomal replication initiator protein, DnaA  36.45 
 
 
449 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  34.14 
 
 
510 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>