More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2651 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2651  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 136 aa  285  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3768  DNA-directed DNA polymerase  95.31 
 
 		 394 aa  265  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3568  DNA-directed DNA polymerase  94.53 
 
 		 393 aa  264  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  59.4 
 
 		 404 aa  173  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  60.16 
 
 		 380 aa  168  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  62.02 
 
 		 385 aa  168  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4919  DNA-directed DNA polymerase  54.62 
 
 		 416 aa  157  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1370  DNA-directed DNA polymerase  53.91 
 
 		 385 aa  152  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.67195 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  49.57 
 
 		 481 aa  133  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  53.45 
 
 		 397 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  46.88 
 
 		 426 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  48.03 
 
 		 386 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  45.97 
 
 		 407 aa  121  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  46.49 
 
 		 408 aa  121  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  49.57 
 
 		 393 aa  120  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  45.76 
 
 		 395 aa  120  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  47.79 
 
 		 402 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  47.79 
 
 		 430 aa  117  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  51.61 
 
 		 385 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  43.08 
 
 		 409 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  44.19 
 
 		 423 aa  114  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  46.49 
 
 		 389 aa  114  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  47.37 
 
 		 436 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  44.62 
 
 		 399 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  47.41 
 
 		 425 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0965  DNA polymerase IV  44.54 
 
 		 350 aa  114  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  45.31 
 
 		 424 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  46.9 
 
 		 407 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  43.41 
 
 		 425 aa  114  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  49.12 
 
 		 384 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  41.73 
 
 		 412 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  46.15 
 
 		 363 aa  113  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  44.85 
 
 		 359 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  46.02 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  44.92 
 
 		 359 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  43.08 
 
 		 359 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  42.5 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  42.37 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  41.22 
 
 		 390 aa  111  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  46.43 
 
 		 453 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  50.91 
 
 		 354 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5260  DNA polymerase IV  44.74 
 
 		 415 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  43.75 
 
 		 410 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  45.13 
 
 		 429 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  46.85 
 
 		 430 aa  110  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  39.5 
 
 		 449 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  44.88 
 
 		 408 aa  110  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  43.86 
 
 		 429 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  44.27 
 
 		 359 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  41.35 
 
 		 409 aa  110  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  44.74 
 
 		 432 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  43.75 
 
 		 445 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  42.86 
 
 		 423 aa  110  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  39.5 
 
 		 417 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1876  DNA polymerase IV  42.64 
 
 		 360 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  43.75 
 
 		 445 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  41.22 
 
 		 391 aa  110  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  42.97 
 
 		 419 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  45 
 
 		 385 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  46.09 
 
 		 418 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  42.98 
 
 		 435 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  43.86 
 
 		 425 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  41.03 
 
 		 417 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  48.15 
 
 		 360 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  43.86 
 
 		 425 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  41.98 
 
 		 356 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  39.69 
 
 		 390 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  43.7 
 
 		 369 aa  108  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  48.18 
 
 		 374 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  44.25 
 
 		 419 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  46.61 
 
 		 364 aa  108  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  44.25 
 
 		 431 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  44.07 
 
 		 399 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  41.86 
 
 		 358 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3296  DNA polymerase IV  42.31 
 
 		 352 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  45.13 
 
 		 415 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  40.94 
 
 		 379 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3157  DNA polymerase IV  42.31 
 
 		 352 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3308  DNA polymerase IV  42.31 
 
 		 352 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00714145  hitchhiker  0.00000429031 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  43.97 
 
 		 418 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0957  DNA polymerase IV  41.09 
 
 		 304 aa  107  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  44.64 
 
 		 435 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  42.19 
 
 		 418 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002716  DNA polymerase IV  40.94 
 
 		 356 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1342  DNA polymerase IV  41.22 
 
 		 359 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  42.11 
 
 		 409 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  42.19 
 
 		 407 aa  106  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  45.05 
 
 		 431 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03264  DNA polymerase IV  40.94 
 
 		 372 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  42.86 
 
 		 409 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  46.02 
 
 		 429 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  44.44 
 
 		 352 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0962  DNA polymerase IV  43.59 
 
 		 353 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  47.22 
 
 		 363 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  47.27 
 
 		 378 aa  105  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  47.27 
 
 		 378 aa  105  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  44.92 
 
 		 364 aa  105  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  40.94 
 
 		 420 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3809  DNA-directed DNA polymerase  47.22 
 
 		 412 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  42.74 
 
 		 351 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>