More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2118 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2118  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 301 aa  616  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0495848  normal  0.686306 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0204  transcriptional regulator, LysR family  30.18 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0533244  normal  0.505533 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3456  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  28.3 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  27.46 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1342  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6126  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  29.48 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  26.78 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3501  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  0.0458146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1877  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018924  normal  0.0294674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.78 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  26.17 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0131  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3471  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0927  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6844  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3783  transcriptional regulator, LysR family  27.01 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5426  transcriptional regulator, LysR family  27.15 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.954201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  31.36 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0678  HTH-type transciptional regulator, LysR-family  27.92 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0849029  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  26.99 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  25.56 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0380  transcriptional regulator LysR family  29.33 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3368  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.24 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.578087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0748  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  29.78 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0147  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1383  transcriptional regulator, LysR family  28.71 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1900  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  22.03 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1367  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000461256  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4453  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.47384 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4587  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.781824  normal  0.831534 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08410  transcriptional regulator  28.75 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00913981  normal  0.237754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  26.55 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2701  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  25.82 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06400  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  25.64 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  25.64 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6619  transcriptional regulator, LysR family  27.01 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  25.48 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  25.64 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  25.64 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0594  putative transcriptional regulator  28.5 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3051  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>