More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0267 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0267  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0758  ribosome recycling factor  90.81 
 
 		 185 aa  344  3e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0529  ribosome recycling factor  51.37 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  43.58 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0241  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.331553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0241  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.743934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0945  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.323347  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0259  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00118776  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0244  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0257  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585226 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2973  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  41.57 
 
 		 184 aa  157  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4079  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0710  ribosome recycling factor  42.93 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0332878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  42.93 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00170  ribosome releasing factor  42.39 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0165  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000948857  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  40 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0182  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000723298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00169  hypothetical protein  42.39 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1149  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2424  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00108894  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1594  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409738  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4183  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1486  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  37.16 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  40 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17100  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  40.91 
 
 		 188 aa  151  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  42.08 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  150  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38960  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3050  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.672962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  39.33 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1713  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 184 aa  147  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.634528  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  38.76 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  37.84 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  38.64 
 
 		 187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  40 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1372  ribosome recycling factor  41.72 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0601267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3832  ribosome recycling factor  38.2 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  40.45 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  40 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  35.91 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  39.89 
 
 		 184 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  38.2 
 
 		 187 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  39.2 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  37.64 
 
 		 186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1534  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 184 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0202403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0300  ribosome recycling factor  35.96 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  38.59 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  41.57 
 
 		 182 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1250  ribosome recycling factor  40.11 
 
 		 182 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  36.76 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  36.52 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  40 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0811  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  36.36 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  37.84 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2521  ribosome recycling factor  37.08 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277739  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  36.31 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1801  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0761482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  141  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1134  ribosome recycling factor  36.36 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  34.83 
 
 		 188 aa  141  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  37.84 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  37.84 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>