More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0945 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0945  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  359  1e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.323347  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0529  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0758  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  159  1e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0267  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  44.77 
 
 		 184 aa  157  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  45.4 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1384  ribosome recycling factor  42.22 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  41.99 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0463  ribosome recycling factor  46.3 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  38.89 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2032  ribosome recycling factor  44.17 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1134  ribosome recycling factor  42.78 
 
 		 186 aa  150  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  44.25 
 
 		 187 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0586  ribosome recycling factor  42.53 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.138909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2521  ribosome recycling factor  43.68 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277739  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1586  ribosome recycling factor  42.22 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1779  ribosome recycling factor  42.22 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_004310  BR1159  ribosome recycling factor  40.8 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0300  ribosome recycling factor  43.68 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1116  ribosome recycling factor  40.8 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  45.4 
 
 		 188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2074  ribosome recycling factor  40.66 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000400705  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3832  ribosome recycling factor  43.68 
 
 		 186 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  40 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  39.66 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  37.3 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  37.3 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0326  ribosome recycling factor  40.22 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.103304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  40 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1372  ribosome recycling factor  46.1 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0601267  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  37.3 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  37.3 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  141  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  37.3 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  36.76 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  36.76 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  38.1 
 
 		 185 aa  141  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0348  ribosome recycling factor  39.13 
 
 		 186 aa  140  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000142199  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2061  ribosome recycling factor  38.59 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.804702  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  41.76 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  37.57 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  41.76 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  36.22 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  41.76 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  41.76 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  41.76 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  41.76 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  36.22 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  42.86 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  41.76 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2403  ribosome recycling factor  38.46 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.130732  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1862  ribosome recycling factor  40.66 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.964954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  42.31 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  39.67 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  42.31 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  42.31 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  42.31 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  40 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  41.76 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  36.41 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  41.76 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  36.22 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  41.76 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  36.22 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  36.76 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  36.21 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  41.21 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  38.25 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  37.93 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  41.9 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  37.3 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  38.04 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0384  ribosome recycling factor  39.13 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010454  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  37.93 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  34.78 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  39.15 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>