More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0529 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0529  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0758  ribosome recycling factor  52.46 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0267  ribosome recycling factor  51.37 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0945  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.323347  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  45.25 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1384  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  46.51 
 
 		 184 aa  164  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2032  ribosome recycling factor  44 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0463  ribosome recycling factor  46.71 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  45.14 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  45.14 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1134  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  44 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1372  ribosome recycling factor  49.08 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0601267  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0586  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.138909  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  45.71 
 
 		 187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0241  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.331553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0257  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0259  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00118776  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0244  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0241  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.743934 
 
 
-
 
NC_004310  BR1159  ribosome recycling factor  42.86 
 
 		 186 aa  161  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1116  ribosome recycling factor  42.86 
 
 		 186 aa  161  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0710  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  160  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0332878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  160  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2973  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  160  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2424  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00108894  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  44.89 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00170  ribosome releasing factor  43.78 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00169  hypothetical protein  43.78 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2521  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0165  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000948857  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  43.18 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1486  ribosome recycling factor  42.62 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0182  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000723298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  158  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38960  ribosome recycling factor  42.08 
 
 		 185 aa  158  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  46.55 
 
 		 184 aa  158  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1534  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 184 aa  158  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0202403 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3832  ribosome recycling factor  43.26 
 
 		 186 aa  157  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17100  ribosome recycling factor  42.08 
 
 		 185 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  44 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4079  ribosome recycling factor  42.62 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  41.53 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  42.08 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  40.98 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  44.25 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  43.43 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  43.43 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1594  ribosome recycling factor  40.98 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409738  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0811  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4183  ribosome recycling factor  40.98 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1713  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.634528  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 190 aa  154  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 190 aa  154  6e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  154  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>