More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3755 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3755  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
390 aa  801    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000260857  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
393 aa  126  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  26.99 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  23.71 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  22.79 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  25.28 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  24.65 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.34 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2714  putative signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
614 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  25.14 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  26.11 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  26.14 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  25.57 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  25.57 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  25.57 
 
 
376 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  25.57 
 
 
376 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  25.57 
 
 
376 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
425 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  25 
 
 
376 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 
440 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.46 
 
 
397 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  25.57 
 
 
376 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  26.99 
 
 
403 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 
402 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 
368 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  26.88 
 
 
720 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3629  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.51 
 
 
446 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000135977  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.83 
 
 
363 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 
561 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  21.83 
 
 
363 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2381  histidine kinase-related ATPase, putative  21.93 
 
 
382 aa  60.1  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.34 
 
 
387 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0173853  decreased coverage  0.000998378 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  25.46 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  23.05 
 
 
395 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 
445 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  25.56 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 
652 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3054  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  27.6 
 
 
382 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  24.34 
 
 
1739 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  25.56 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  25.56 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1973  histidine kinase  25.5 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1939  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  25.49 
 
 
338 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.72 
 
 
392 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000249738  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.81 
 
 
682 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  25.56 
 
 
351 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  22.15 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1647  histidine kinase  26.23 
 
 
308 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  22.97 
 
 
406 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.46 
 
 
364 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.77 
 
 
372 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  25.11 
 
 
351 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3069  histidine kinase  21.31 
 
 
392 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0020907  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  25.11 
 
 
351 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  25.11 
 
 
351 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  25.11 
 
 
351 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  25.11 
 
 
351 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 
363 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.89 
 
 
385 aa  56.2  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  27.06 
 
 
442 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
644 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  25.11 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  22.85 
 
 
657 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.72 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000812126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  24.4 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
359 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
412 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0623  histidine kinase  25.68 
 
 
403 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1152  putative signal transduction histidine kinase  21.74 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.77 
 
 
1648 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 
692 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.55 
 
 
795 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.32 
 
 
359 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 
624 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.55 
 
 
795 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  24.87 
 
 
356 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1803  putative sensor histidine kinase  19.48 
 
 
366 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 
509 aa  53.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  23.22 
 
 
595 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 
332 aa  53.9  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  26.17 
 
 
399 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
730 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
333 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 
731 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.85 
 
 
408 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1607  sensor histidine kinase  19.48 
 
 
366 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 
1168 aa  53.5  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
393 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.55 
 
 
795 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
358 aa  53.1  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
451 aa  53.1  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  21.36 
 
 
378 aa  53.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>