167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3629 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3629  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 446 aa  912    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000135977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  25.96 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  26.56 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.05 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  27.01 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  24.79 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3755  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.51 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000260857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.87 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1840  putative sensor histidine kinase  23.96 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1660  sensor histidine kinase  23.96 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1638  sensor histidine kinase  23.96 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000803844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1607  sensor histidine kinase  23.96 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1792  sensor histidine kinase  23.96 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1657  histidine kinase  23.96 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.174163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  22.78 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  25 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2381  histidine kinase-related ATPase, putative  24.64 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1864  sensor histidine kinase, putative  23.96 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1914  putative sensor histidine kinase  24.42 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.792707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3537  sensory Transduction Protein Kinase  24.31 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  26.17 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1803  putative sensor histidine kinase  23.5 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  25 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  24.63 
 
 		 466 aa  57  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0564  histidine kinase  26.69 
 
 		 368 aa  57  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  23.58 
 
 		 397 aa  57  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 610 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.38 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  24.1 
 
 		 595 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  25.63 
 
 		 597 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0853  putative signal transduction histidine kinase  21.43 
 
 		 572 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000112347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3218  histidine kinase  23.24 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  24.44 
 
 		 379 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  24.88 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 		 404 aa  54.3  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5427  histidine kinase  23.76 
 
 		 437 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.315335 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 402 aa  53.5  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  25.96 
 
 		 470 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  23.21 
 
 		 592 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.21 
 
 		 357 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  24.12 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 595 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  22.33 
 
 		 508 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1821  histidine kinase  21.4 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  22.04 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  21.96 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  23.94 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3677  histidine kinase  25.59 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  22.27 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  23.55 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 		 601 aa  51.2  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 464 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 363 aa  50.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 372 aa  50.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  22.07 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1153  putative signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 471 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  31.45 
 
 		 772 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1101  sensor histidine kinase, putative  24.77 
 
 		 405 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0148  histidine kinase-related ATPase, putative  26.09 
 
 		 289 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  23.93 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  23.93 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5551  histidine kinase  27.07 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  0.129441 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  23.16 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  20.05 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0645  histidine kinase  22.94 
 
 		 849 aa  49.3  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.386333 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 869 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  23.32 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  24.87 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  22.69 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1152  putative signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  23.92 
 
 		 594 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  23.96 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0918  histidine kinase  23.55 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.93 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  25.21 
 
 		 529 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  21.74 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  24.86 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1223  putative signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  25.49 
 
 		 451 aa  48.5  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.62 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  26.05 
 
 		 403 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  26.32 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>