More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1060 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
368 aa  754    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1607  sensor histidine kinase  52.73 
 
 
366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1864  sensor histidine kinase, putative  53.01 
 
 
366 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1660  sensor histidine kinase  52.19 
 
 
368 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1792  sensor histidine kinase  52.19 
 
 
368 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1657  histidine kinase  52.73 
 
 
366 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.174163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1638  sensor histidine kinase  52.73 
 
 
368 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000803844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1914  putative sensor histidine kinase  52.73 
 
 
366 aa  391  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.792707  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1840  putative sensor histidine kinase  52.46 
 
 
368 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1803  putative sensor histidine kinase  52.46 
 
 
366 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3537  sensory Transduction Protein Kinase  54.68 
 
 
332 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
385 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2381  histidine kinase-related ATPase, putative  23.75 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 
402 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
440 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
445 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
393 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
407 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2626  putative signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  29.49 
 
 
384 aa  94  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
401 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  28.37 
 
 
597 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
595 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
397 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  28.16 
 
 
595 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  25.81 
 
 
325 aa  86.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.65 
 
 
370 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  25.1 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  29.46 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  27.67 
 
 
592 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  24.91 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.18 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  27.05 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  27.67 
 
 
595 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  25.3 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  26.6 
 
 
403 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  25.69 
 
 
489 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.29 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
552 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  25.64 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  28.28 
 
 
1046 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  28.42 
 
 
420 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  30.3 
 
 
430 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  21.28 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  23.86 
 
 
1093 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  26.87 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
665 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  28.24 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  26.59 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  26.83 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 
652 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
438 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  27.62 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
574 aa  79.7  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  26.79 
 
 
430 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  23.87 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  23.39 
 
 
474 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  26.89 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  26.89 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  26.89 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  26.89 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  26.89 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  26.89 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 
485 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  27.27 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  24.02 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  25.79 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  28.64 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  24.38 
 
 
412 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  24.53 
 
 
395 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  25.64 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  26.42 
 
 
429 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  22.95 
 
 
485 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  26.59 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
586 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  27.5 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  25.19 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  25.19 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  26.49 
 
 
463 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  29.12 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  30.41 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  25.54 
 
 
640 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 
682 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  26.15 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 
485 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 
508 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  28.12 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  28.64 
 
 
2361 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5427  histidine kinase  25.45 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.315335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.27 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>