More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1675 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1675  peptidase S24 and S26 domain protein  100 
 
 
132 aa  270  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  66.34 
 
 
189 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  54.35 
 
 
173 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  49.46 
 
 
181 aa  90.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  44.23 
 
 
200 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  44.23 
 
 
200 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  41 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  45.65 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  52.44 
 
 
220 aa  77.8  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  45.83 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  36.61 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  37.27 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  41.3 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  42.7 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  37.19 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  45.65 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  43 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  41.58 
 
 
214 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  42.71 
 
 
288 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  41.24 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  46.59 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  39.77 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  38.14 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  48.65 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  35.79 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  39.09 
 
 
380 aa  67.4  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  42.39 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  43.56 
 
 
185 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  37.5 
 
 
215 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  35.79 
 
 
208 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  43.62 
 
 
217 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  33.93 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  33.93 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  43.68 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  46.84 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  32.76 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  34.92 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  36.54 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  41.38 
 
 
183 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  35.87 
 
 
188 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  38.61 
 
 
245 aa  63.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  34.17 
 
 
219 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  39.18 
 
 
199 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  38.04 
 
 
187 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  38.16 
 
 
215 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  37.5 
 
 
297 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  38.83 
 
 
260 aa  63.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  39.58 
 
 
297 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  34.55 
 
 
220 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  35.63 
 
 
187 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  31.07 
 
 
189 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  38.54 
 
 
305 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05701  Signal peptidase I  34.13 
 
 
219 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  33.61 
 
 
259 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0514  Signal peptidase I  30.86 
 
 
219 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.299023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  36.46 
 
 
325 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  39.25 
 
 
304 aa  61.6  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  37.11 
 
 
321 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  35.87 
 
 
187 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  35.87 
 
 
187 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  41.67 
 
 
184 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  35.87 
 
 
187 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  34.65 
 
 
194 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  41.86 
 
 
288 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05401  Signal peptidase I  29.87 
 
 
219 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  35.87 
 
 
187 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  38.54 
 
 
268 aa  61.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  37.11 
 
 
321 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  36.84 
 
 
200 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  35.87 
 
 
187 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  35.87 
 
 
187 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  28.33 
 
 
191 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  28.33 
 
 
191 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  43.84 
 
 
203 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  37.89 
 
 
184 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  32.54 
 
 
225 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  41.46 
 
 
248 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  41.46 
 
 
248 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  34.65 
 
 
194 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  34.78 
 
 
187 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  30.94 
 
 
284 aa  60.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  34.78 
 
 
187 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  34.78 
 
 
187 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  35.42 
 
 
194 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  32.77 
 
 
263 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  37.5 
 
 
192 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  34 
 
 
193 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  45.56 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  38.61 
 
 
260 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  38.32 
 
 
305 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  33.93 
 
 
196 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  38.61 
 
 
260 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  35.14 
 
 
268 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  42.31 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  34.38 
 
 
332 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  40.45 
 
 
305 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  37.38 
 
 
305 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  33.33 
 
 
252 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  33.33 
 
 
322 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  38.32 
 
 
305 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>