More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1329 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1329  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 114 aa  236  9e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  50.49 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  50.98 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  50.96 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  50.96 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  44.55 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  50.98 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  48.65 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  47.62 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  44.04 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  46.6 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  45.22 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  45.45 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  42.73 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  45.45 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  45.45 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  46.6 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  41.82 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0428  Hit family protein  43.69 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  42.73 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  41.9 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  46 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  46 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  46 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  45.05 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  47.62 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  40.91 
 
 		 117 aa  94.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  44.04 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1120  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 117 aa  94.4  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1214  histidine triad-like protein  45.45 
 
 		 117 aa  94.4  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.574759  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0860  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  44.14 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  41.23 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 		 115 aa  94  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  42.73 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  42.34 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 117 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  42.99 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  44.12 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  44.66 
 
 		 113 aa  93.6  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  45.63 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  42.72 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  43.56 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  43.27 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  44.55 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  43.56 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  40.74 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0691  histidine triad (HIT) protein  43.14 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2276  HIT family protein  38.18 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264441  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  40.35 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  43 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 		 112 aa  90.5  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0977  HIT family protein  42.86 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  41.75 
 
 		 114 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  43.56 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1971  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  42.99 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  41.9 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  41.9 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0915  HIT family protein  42.86 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1298  thioredoxin  42.86 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.393831  decreased coverage  0.00542424 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0907  HIT family protein  42.86 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.801892  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00781  HIT (histidine triad) family protein  42.72 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  40.2 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  39.05 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1195  HIT family hydrolase  41.9 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.578491  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0069  HIT (histidine triad) family protein  41.75 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  43.69 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0487  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  40.35 
 
 		 118 aa  87.4  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  38.26 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 		 118 aa  87  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00761  HIT (histidine triad) family protein  45.54 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0278345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00791  HIT (histidine triad) family protein  41.75 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.715274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>