108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0328 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  100 
 
 		 225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  44.23 
 
 		 299 aa  190  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  43.91 
 
 		 257 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  47.42 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  47.42 
 
 		 301 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  43.46 
 
 		 297 aa  177  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  43.48 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  42.51 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  44.5 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  37.73 
 
 		 230 aa  157  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  44.09 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  43.55 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  39.11 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  37.67 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  39.18 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  42.31 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  33.77 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  38.42 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  37.5 
 
 		 233 aa  124  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  34.29 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  41.96 
 
 		 217 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  41.96 
 
 		 217 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  30.7 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  35.23 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  32.24 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  34.66 
 
 		 399 aa  105  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.518781 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  35.23 
 
 		 410 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  30.36 
 
 		 327 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  31.98 
 
 		 249 aa  98.6  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  29.89 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  32.63 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  30.41 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  23.98 
 
 		 242 aa  88.2  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 		 242 aa  84.7  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  25.82 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  30.43 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1381  hypothetical protein  25.12 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0802704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  25.65 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  30.94 
 
 		 604 aa  79.7  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0525  putative secreted protein  28.64 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0732  putative secreted protein  28.64 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  30.27 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1385  hypothetical protein  23.96 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  24.7 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  27.03 
 
 		 556 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10288  conserved hypothetical protein  25.14 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  27.27 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  31.06 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1399  hypothetical protein  31.87 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  27.91 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  31.82 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  27.47 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  28.25 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  27.13 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  26.36 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  31.11 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  31.82 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  28.99 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  24.71 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  29.89 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  30.05 
 
 		 177 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  31.06 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  25.47 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  26.52 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  27.33 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04590  actin filament organization-related protein, putative  31.29 
 
 		 522 aa  48.9  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  24.71 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  26.37 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44183  predicted protein  22.04 
 
 		 1316 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125536  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  30.91 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  31.37 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  26.26 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  31.46 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  25.81 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  27.91 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  25.42 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  27.91 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  28.68 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  34.57 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  28.68 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  28.68 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  23.42 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  29.46 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  29.46 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  29.46 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  29.07 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  29.84 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  28.68 
 
 		 195 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  28.68 
 
 		 195 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>